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分析pcr儀擴(kuò)增產(chǎn)物電泳分析時沒有條帶

更新時間:2013-05-31瀏覽:3879次

   產(chǎn)生pcr儀擴(kuò)增產(chǎn)物在電泳分析時沒有條帶或條帶很淺的原因有以下幾種:

1、反應(yīng)體系是PCR的反應(yīng)體系而不是RT-PCR的反應(yīng)體系,這是常見的原因;

2、與反應(yīng)起始時RNA的總量及純度有關(guān):建議在試驗中加入對照RNA;

3、*鏈的反應(yīng)產(chǎn)物在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時,在總的反應(yīng)體系中的含量不要超過1/10:建議用Oligo(dT)或隨機(jī)引物代替基因特異性引物(GSP)用于*鏈合成。

4、由于RNA模板存在二級結(jié)構(gòu),如環(huán)狀結(jié)果,有可能導(dǎo)致GSP無法與模板退火;或SSⅡ反轉(zhuǎn)錄酶無法從此引物進(jìn)行有效延伸。

5、目的mRNA中含有強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄中止位點,可以試用以下方法解決:

①將*鏈的反應(yīng)溫度提高至50℃。

②使用隨機(jī)六聚體代替Oligo(dT)進(jìn)行*鏈反應(yīng)。

 

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